嘉庚學(xué)院實(shí)行董事會(huì)領(lǐng)導(dǎo)下的院長(zhǎng)負(fù)責(zé)制。作為學(xué)校的決策機(jī)構(gòu),董事會(huì)全權(quán)負(fù)責(zé)學(xué)校的管理運(yùn)作。董事長(zhǎng)為學(xué)校法定代表人。學(xué)校設(shè)立由院長(zhǎng)主持的院務(wù)會(huì),研究決定學(xué)校的發(fā)展規(guī)劃、教育教學(xué)改革、師資隊(duì)伍建設(shè)和對(duì)外合作與交流等各項(xiàng)重大決策,并負(fù)責(zé)評(píng)估、監(jiān)察學(xué)校的教學(xué)、科研和行政管理工作。學(xué)?,F(xiàn)設(shè)有20個(gè)教學(xué)科研單位和若干個(gè)管理部門。